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     |  | col1とcol3の値に問題があると思います。 いずれも値が1になっているので、Forループからすぐに抜けてしまうようです。
 
 cols1 = .UsedRange.Cells(.UsedRange.Rows.Count, 1).Column
 cols3 = .UsedRange.Cells(.UsedRange.Rows.Count, 1).Column
 
 これはいずれもColumnがRowの誤りでしょう。
 CellsプロパティでColumnを1に指定しているのですから、そこから得られたセルのColumnを取得すれば1にしかなりません。
 
 それと、これを修正しても問題が残っています。
 ループに入ってからの
 If ws6.Range("B" & migi).Value = ws1.Range("D" & hida).Value Then
 ですが、migiはmaster(ws1)の行数、hidaはdaily3(ws6)の行数を表しているのですから、ここでは逆でしょう。
 
 同じく、
 ws3.Range("A" & hida).Value = ws1.Range("B" & hida).Value
 ws3.Range("B" & hida).Value = ws1.Range("D" & hida).Value
 ws3.Range("C" & hida).Value = ws1.Range("C" & hida).Value
 ws3.Range("D" & hida).Value = ws1.Range("A" & hida).Value
 は、いずれも=の右側の式でhidaをmigiに修正する必要があると思われます。
 
 以上で、私が手元で試してみた範囲では動作しました。
 
 
 なお、動作には支障がないのですが、変数名は直した方がいいですね。ws1とかcols1とかhidaとか、何を表しているのかわかりません。私がコードを読む際にも、結構読みにくかったですよ。
 ws1ならsh_masterのような、中身がわかる変数名にするか、いっそのこと変数を使わずにWorksheets("master")だけでもいいのではないでしょうか。
 
 それに、シートの選択方法が、ws1のような変数を使ったり、Worksheet("シート名")になっていたり、ActiveSheetになっていたりで、やはりどのシートを指定しているのかがわかりにくいです。特にActiveSheetは手前のコードを読んでどこのシートがアクティブになっているのかを調べないとわかりませんし、そもそもそのシートをアクティブにする処理が余計です。
 
 あと、サンプル程度のデータ量ならこれでもすぐ終わると思いますが、件数が多くなってくるとセルの読み書きの回数が多くなり、処理に時間がかかるようになりますよ。
 Variant型変数にセル範囲を代入して配列として扱う方法がありますので、余裕があれば勉強してみてはどうでしょうか。
 ht tp://officetanaka.net/excel/vba/speed/s11.htm
 
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